Detta är kanske den viktigaste händelsen för Skrylleområdet. Reservatsskyddet innebär att området är skyddat mot framtida exploateringar och förhoppningsvis kommer markområdet att för överskådlig tid bevaras för friluftsliv och rekreation.
Natten mellan den 3 och 4 december 1999 började ännu en ny epok i områdets skogshistoria. Då blåste ca 100 ha granskog ner i en av de svåraste stormar som någonsin drabbat Skrylleskogen. Stormen kallades Carola. Granskogen ersattes av bok-, ek och björkskog.
I dag är skogsbruksplanens målsättning att minska granens andel i hela området vilket också kommer att påverka den biologiska mångfalden positivt. Utbytet för svamp- och bärplockare kommer att öka. Huvudsaken är att försöka återställa den naturligt framvuxna skog som fanns här på medeltiden (granen förekommer inte naturligt i södra Skåne).
Sedan 1996 är det Park- och Naturkontoret inom Tekniska förvaltningen som har ansvaret för c:a 400 hektar skog i området. Man är naturvårdsförvaltare även för Stiftelsens för fritidsområden i Skåne marker, c:a 170 hektar, samt Måryd och Fågelsångsdalen. Området närmast Skryllegården, inklusive Skryllesjön, sköts av Friluftsfrämjandets Lundaavdelning.
Trots att Skrylle nu är omgivet av 11 skyddade områden finns ytterligare mark på samhällets önskelista, t.ex. fäladslandskapet mellan Dalby och Hällestad. Här föreslog Skryllerådet ett reservat vid Jonstorp, en vacker enefälad med översilningsmarker och orkidékärr. Rådgivande beslut togs i Skryllerådet i december 1996 och Lunds kommun köpte marken 1998. Kommunen äger också området Rökepipan som blev reservat 2012.